monchi98さん こんにちはー
Windows版は試しておりませんが、以下の記事を見つけました。
http://ja.softether.org/4-docs/1-manual/7/7.6
また、このような投稿も
http://www.vpnusers.com/viewtopic.php?f=7&t=31
以上のことから
1.PacketiX 4.0RC3をアンインストール
2.同一のディレクトリにSoftEther VPNをインストール
3.同一のディレクトリに残されたコンフィグレーションファイル等により設定は引き継がれ、再設定は不要
かと思われます。
念のためにコンフィグレーションファイル等のバックアップを取り、試してみては如何でしょうか?